Кэнъити Сирахама, обычный школьник, переезжает в додзё Рюдзандзи. Там он встречает Миу Фуриндзи, которая становится его наставницей. В додзё живут мастера боевых искусств: Апачай, Сакаки, Косэи. Кэнъити начинает тренировки, сталкиваясь с трудностями: "Ты слишком слаб", — говорит Апачай. Параллельно он ввязывается в конфликты с бандой Рагнарёк. После изнурительных тренировок и драк Кэнъити побеждает лидера банды Одана Нджибы. В финале он возвращается в додзё, где его ждут Миу и мастера.
Котаро, студент-медик, живет в Токио. Его отец, врач, покончил с собой. В квартире пахнет лекарствами, на столе — недопитый кофе. Котаро находит дневник отца с записями о пациентке Кирико, страдающей от редкой болезни. Он разыскивает её: «Вы знали моего отца?» Кирико молчит, курит у окна. Они едут в заброшенную клинику. Там — пустые палаты, шприцы на полу. Котаро читает: «Она не должна была выжить». Кирико исчезает. Он звонит ей — тишина. Ветер шевелит страницы дневника.
В 1944 году мир охвачен войной с инопланетными существами — Нейрои. Юная Ёсика Мияфудзи, мечтающая стать пилотом, прибывает на базу в Британию. Там она знакомится с отрядом «Штурмовых ведьм»: Линн, Перрин, Эйла, Саша и другие. Девушки используют магию и технологии для борьбы с врагом. Ёсика тренируется, осваивая летающий боевой костюм. В разгар битвы она спасает Линн, рискуя собой. После боя команда отдыхает в казарме, обсуждая планы. Ёсика понимает: её место — среди них.
Юкио, бывший учитель, возвращается в родной городок у реки Берди. Его отец, Исаму, владеет старой лодочной мастерской. «Ты снова здесь только из-за денег?» — бросает сестра Наоко. Юкио молчит, чинит прогнившие доски. В баре «Акаифуне» пьёт с рыбаками, вспоминает детские драки. Однажды находит в воде полуразрушенную лодку, решает восстановить. Помогает соседка Мидори: «Опять твои дурацкие идеи». Шторм, падающие ветки, потрескавшаяся краска. В финале лодка плывёт по мутной воде, Юкио кричит