В 11945 году, после вторжения инопланетных машин, Земля опустела. Андроиды 2B и 9S служат Йорхе — базе сопротивления. Они исследуют руины Токио, сражаются с роботами-врагами. «Зачем мы убиваем?» — спрашивает 9S. «Приказ», — отвечает 2B. В подземном бункере находят странные данные о проекте «Гештальт». Позже 2B случайно активирует древний терминал, где голос шепчет: «Вы всего лишь копии». 9С, новый андроид, присоединяется к ним. В финале база Йорха разрушена, а герои бегут в пустыню,
Париж, ночь. Маринетт спит, её будит Тихо — говорящий кулон Камии. «Тык-тык, время спасать город!» На крыше она встречает Кота Нуара. «Опять проспала?» — усмехается он. Новый злодей — маг Феликс, превращает людей в каменные статуи. Леди Баг ловит его лассо, но он вырывается: «Вы слабее, чем я думал». В подземелье находят древний артефакт — перстень с драконом. Маринетт примеряет его: «Ой, горячо!» Перстень даёт силу управлять временем. Феликс крадёт его, но Кот бьёт его посохом: «Отдавай!»
В Киото молодой оммёдзи Абэ но Сэймэй расследует серию загадочных смертей. Его напарник, грубоватый воин Минамото но Ёримицу, скептичен: «Опять твои духи?» Они находят следы проклятия в старом храме, где Сэймэй замечает обрывок бумажного талисмана. Ночью в переулке их атакует ёкай — тень с горящими глазами. Сэймэй рисует печать на стене лавки, но монстр исчезает. В хижине старуха шепчет: «Ищи женщину в красном кимоно». На рассвете герои пробираются в запретный квартал, где встречают танцовщицу
В токийском кафе «Лаванда» бармен Такуро находит старую шкатулку с письмами 1960-х. В них — история студента Кейта и художницы Мидори. Он пишет: «Завтра принесу краски, ты закончишь портрет?» Она отвечает: «Только если будешь сидеть смирно». Письма перемежаются счетами за аренду и билетами в кино. Такуро ищет следы Мидори, узнаёт — она умерла в 72-м. В последнем письме Кейт: «Уезжаю. Шкатулку оставлю у тебя». Такуро кладёт её обратно, задвигает ящик стола.
Маринетт и Адриан, переехав в Лондон, сталкиваются с новыми угрозами. В кафе на Бейкер-стрит Маринетт роняет круассан, замечая странную тень. Адриан, рисуя в скетчбуке, говорит: «Здесь что-то не так». Ночью они становятся Леди Баг и Котом Нуаром, преследуя злодея у Тауэрского моста. Злодей — бывший часовщик, использующий магию времени. В подземелье под Биг-Беном герои находят древний артефакт. «Это может уничтожить город», — шепчет Маринетт. Адриан хватает её за руку: «Мы справимся».
В Токио 1945 года Ритсука Фудзимори, обычный школьник, находит древний артефакт. Внезапно его переносит в параллельный мир, где магия — обычное дело. Встречает Гильгамеша, который грубо говорит: «Ты здесь лишний». Рядом — рыжеволосая девушка Ольга, воюющая с механическими драконами. Они скрываются в разрушенном храме, где Ритсука узнаёт о «Великом приказе» — заклинании, способном изменить реальность. Ольга хрипло шепчет: «Если не мы, то кто?» На них нападают тени, город рушится. Гильгамеш