Кайра Кэмерон, офицер из 2077 года, попадает в 2012-й после взрыва бомбы террористов «Свободных». Вместе с ней переносятся несколько преступников во главе с Эдвардом Либи. Кайра ищет способ вернуться, скрываясь в Ванкувере. Она устраивается в полицию под прикрытием, работает с детективом Карлосом Фонедой. Либи собирает команду, планирует изменить будущее. Кайра взламывает базы данных, находит следы корпорации «СэдТек». «Они уже здесь», — шепчет она, глядя на старые чертежи.
В маленьком городке Бейли после исчезновения отца 12-летний Джек Салливан и его друзья — ботаник Квентин, задира Дарик и осторожная Джун — пытаются выжить среди монстров, появившихся из ниоткуда. В подвале дома Джека они находят робота по имени Пятак, который знает о «Реквиеме» — устройстве, способном остановить вторжение. Ребята решают добраться до лаборатории доктора Зика, где спрятан чертёж. По пути сталкиваются с тенеподобными существами — «Призраками». «Ты уверен, что это сработает?» —
Агенты ФБР Малдер и Скалли расследуют загадочные случаи исчезновений в небольшом городке. Малдер, одержимый паранормальным, находит связь с экспериментами над людьми. Скалли, скептик, анализирует медицинские данные. Они сталкиваются с бывшим священником, утверждающим, что общается с душами пропавших. В заброшенной церкви находят странные символы и следы крови. Малдер: «Это не просто совпадение». Скалли: «Но доказательств нет». В финале они раскрывают сеть подпольных опытов, но ключевой