В 1944 году мир охвачен войной с инопланетными существами — Нейрои. Юная Ёсика Мияфудзи, мечтающая стать пилотом, прибывает на базу в Британию. Там она знакомится с отрядом «Штурмовых ведьм»: Линн, Перрин, Эйла, Саша и другие. Девушки используют магию и технологии для борьбы с врагом. Ёсика тренируется, осваивая летающий боевой костюм. В разгар битвы она спасает Линн, рискуя собой. После боя команда отдыхает в казарме, обсуждая планы. Ёсика понимает: её место — среди них.
Рейн и Альтина возвращаются в Эребонию после событий в Кросбелле. Они встречают старых друзей: Элиота, Макиаса, Юну. В столице Хеймдалль нарастает напряжение — Северный Железнодорожный Союз готовится к войне. Рейн, работая под прикрытием, узнаёт о планах захвата стратегических объектов. В кафе "Ламарр" он передаёт данные Альтине: "Их поезд отправляется завтра на рассвете". Бои вспыхивают у моста Гаргель, где группа пытается остановить вражеский состав. Юна кричит: "Мы
В маленьком городке на окраине Хоккайдо 17-летний Юма находит в подвале старого дома потрёпанный дневник. На страницах — записи его покойной бабушки Митико о войне. «Сегодня снова бомбили. Соседский мальчик не вернулся», — разбирает он дрожащими пальцами. В библиотеке Юма встречает Саюри, которая помогает ему расшифровать старые карты. Они ищут бункер, упомянутый в дневнике. Под слоем ржавых листьев — детская туфелька и медальон. «Она так и не смогла его забыть», — шепчет Саюри, вытирая грязь с