В небольшом городке Блэк-Рок, штат Мэн, подростки Лия и Джейкоб случайно находят старый бункер. Внутри — странные символы на стенах, записи на непонятном языке. "Это похоже на шифр", — шепчет Лия, листая пожелтевшие страницы. Внезапно дверь захлопывается. Снаружи слышен гул: город исчез, вокруг лишь пустота. "Мы в ловушке", — говорит Джейкоб, проверяя сигнал телефона. Они находят карту с отметками других бункеров. Каждый шаг сопровождается странными звуками, будто кто-то
В центре сюжета — агент ЦРУ Том Бишоп, который пытается спасти свою жену Элизабет, обвинённую в шпионаже. Действие разворачивается в Берлине, Париже и Токио. Том нарушает приказы, чтобы доказать её невиновность. В Париже он встречает информатора Мартина, который говорит: «Ты играешь с огнём, Бишоп». В Токио Том сталкивается с японским агентом Сато, который преследует его по всему городу. В финале Том взрывает лабораторию, уничтожая улики против Элизабет, но сам оказывается в ловушке.
В 2263 году таксист Корбен Даллас везёт пассажирку — рыжую Лилу — в аэропорт. Она выпрыгивает из машины, оставив медальон. Тем временем жрец Витто Корнелиус и генерал Мун обсуждают древнее зло, которое пробуждается. Лилу похищают, но Даллас находит её в отеле «Флостон Парадайз». Она — Пятый элемент, созданный для борьбы с Тьмой. Вместе с диджеем Руби Родом они летят на планету Фастол, где открывают храм. «Камень... огонь... вода... воздух...» — бормочет Корнелиус. Лилу активирует оружие светом