Ясукэ — бывший самурай, теперь перевозчик на лодке. В лесу он находит девочку Сачи, у которой странные способности: она может управлять тёмной энергией. За ней охотятся христианские миссионеры и колдуны во главе с Дайкан. Ясукэ решает защитить её. Они плывут по реке, прячутся в деревнях, но враги настигают. «Ты не обычный ребёнок», — говорит он Сачи. В финале Дайкан превращается в демона, но Ясукэ побеждает его мечом. Сачи исчезает, оставив только следы на песке.
В маленьком городке живёт девочка Айя с отцом-изобретателем. Однажды она находит раненую фею Юри, у которой украли хвост — источник магии. Вместе с другом Котаро они отправляются в лес, где старый учёный Хигаки создаёт механических существ. "Без хвоста я не смогу летать", — жалуется Юри. Дети проникают в лабораторию, находят хвост среди шестерёнок и проводов. Хигаки пытается остановить их: "Магия должна служить науке!" Побег, драка с роботами. В конце Юри восстанавливает
В Токио, 1969 год. Студент Кэнтаро, 22 года, живет в крошечной квартире с подругой Юки. Он увлечен марксизмом, мечтает о революции. Вместе с друзьями — Такаши и Акирой — они планируют захват университета. Кэнтаро: «Мы должны действовать сейчас, иначе всё потеряет смысл». Юки беспокоится: «Ты слишком увлекся». В день акции Кэнтаро берет пулемет, но всё идет не по плану. Полиция окружает здание. Такаши кричит: «Сдавайся!» Кэнтаро колеблется, вспоминая слова Юки. Выстрелы. Конец.
Нагатэ Танэкадзу, командуя «Цугуми», атакует Гарду 647. На борту «Сидонии» Идзуна Хироока чинит системы жизнеобеспечения, ворча: «Опять эти провода...» Капитаны Очиай и Кобаяси спорят о тактике. Томидзу Юки, пилотируя «Хаяна», сталкивается с Гардой в секторе D-12. «Ты уверена, что это сработает?» — спрашивает она Нагатэ по связи. Тем временем Норио Куниато исследует древние записи в архивах, находя странные символы. На кухне Самари Идзухо готовит рамен для экипажа, пока за окном вспыхивают огни